El Dr. Francisco Malano realiza investigación principalmente en el área de la Física Aplicada a la Medicina y Física Médica. Sus trabajos se focalizan en el uso de herramientas de simulación aplicadas al cálculo de transporte de radiación ionizante, en particular, el uso de códigos de simulación basados en el método Monte Carlo. Las aplicaciones de su investigación abarcan múltiples temáticas de la Física Médica, entre las que se destacan la Radioterapia y la Radiología. Sus investigaciones involucran diseño y caracterización de equipamiento moderno para Radioterapia, dosimetría paciente-específico y caracterización de equipos de diagnóstico, destacando investigación reciente en la Tomografía por Fluorescencia de Rayos X (XFCT).